Koronavirüs mutasyonları

Ocak ayının başlarında, COVID-19'a neden olan virüs olan Sars-CoV-2'nin ilk genom dizisi "Wuhan-1" adı altında piyasaya sürüldü. 30.000 harflik bu dizi (genetik kodun A, T, C ve G'leri), bu yeni keşfedilen koronavirüsün genetiğini anlamak için yarışta ilk günü işaretledi. Şimdi, 100'den fazla ülkedeki COVID-19 hastalarından örneklenen 100.000 koronavirüs genomu Wuhan-1'e katıldı. Dünyanın dört bir yanındaki genetikçiler cevaplar için verileri araştırıyor. Sars-CoV-2 nereden geldi? İnsanları enfekte etmeye ne zaman başladı? Virüs nasıl mutasyona uğruyor ve bu önemli mi? Sars-CoV-2 genomiği, virüsün kendisi gibi, büyüdü ve küreselleşti.

Mutasyon terimi, tüm gezegeni süpüren gelişmiş yeteneklere sahip tehlikeli yeni virüslerin görüntülerini çağrıştırır. Ve mutasyonlar sürekli ortaya çıkarken ve bazen süpürürken - Sars-CoV-2'deki erken mutasyonlar, virüs neredeyse fark edilmeden yayılırken dünya çapında yol aldı - mutasyonlar, virüsler de dahil olmak üzere herhangi bir organizmanın tamamen doğal bir parçasıdır. Büyük çoğunluğun bir virüsün hastalığa bulaşma veya hastalığa neden olma yeteneği üzerinde hiçbir etkisi yoktur.

Bir mutasyon sadece bir fark demektir; genomda bir harf değişikliği. Sars-CoV-2 popülasyonu, 2019'un sonlarında ilk insan konağına atladığında genetik olarak temelde değişmezken , bu değişikliklerin 13.000'den fazlası şu ana kadar dizilenen 100.000 Sars-CoV-2'de bulunuyor. Yine de dünyanın herhangi bir yerindeki herhangi iki hastadan alınan herhangi iki virüs ortalama olarak yalnızca on harfle farklılık gösterir . Bu, virüsün genetik kodundaki toplam 30.000 karakterin küçük bir kısmıdır ve dolaşımdaki tüm Sars-CoV-2'nin tek bir klonal soyun parçası olarak kabul edilebileceği anlamına gelir.

Yavaş yavaş değişiyor

Virüsün önemli bir genetik çeşitlilik kazanması biraz zaman alacak. Sars-CoV-2, bir virüs için oldukça yavaş mutasyona uğrar ve herhangi bir soy her ay birkaç değişiklik alır ; Aynı dönemde influenza virüsleri tarafından edinilen mutasyonların sayısından iki ila altı kat daha düşük .

Yine de mutasyonlar, doğal seçilimin üzerinde hareket edebileceği temel ilkelerdir. En yaygın olarak mutasyonlar, bir virüsü işlevsiz kılar veya hiçbir etkiye sahip değildir. Yine de, mutasyonların yeni insan konakçılarında Sars-CoV-2'nin bulaşabilirliğini etkileme potansiyeli mevcuttur. Sonuç olarak, Wuhan'da ilk Sars-CoV-2 genomunun dizilenmesinden bu yana tanımlanabilen mutasyonlardan varsa hangisinin viral işlevi önemli ölçüde değiştirebileceğini belirlemek için yoğun çabalar olmuştur.

Bu bağlamda kötü şöhretli bir mutasyon, koronavirüslere karakteristik taç benzeri projeksiyonları veren ve konakçı hücrelere bağlanmasına izin veren protein olan Sars-CoV-2 spike proteinindeki bir amino asit değişikliğidir. Viral genomdaki - D614G olarak adlandırılan - bu tek karakter değişikliğinin , hastalığın şiddeti üzerinde ölçülebilir bir etkisi olmasa da laboratuvarda yetiştirilen hücrelerde virüs bulaşabilirliğini artırdığı gösterilmiştir. Bu mutasyon aynı zamanda sistematik olarak diğer üç mutasyonla birlikte bulunsa da ve dördü de artık sekanslanmış Sars-CoV-2'nin yaklaşık %80'inde bulunsa da, onu dolaşımdaki en sık mutasyon kümesi yapıyor.

Diğer mutasyonlarda olduğu gibi, D614G ile ilgili zorluk, erken başarılı salgınları tohumlamaktan sorumlu virüslerde mevcut oldukları için sıklıkta artmış olup olmadıkları veya taşıyıcılarına gerçekten bir avantaj sağlayıp sağlamadıkları konusunda çözülüyor. Birleşik Krallık'taki bir veri seti üzerinde yapılan genom bilimi, D614G'nin onu taşıyan soyların büyüme oranını artırmada ince bir rol oynadığını öne sürse de, bizim kendi çalışmamız iletim üzerinde ölçülebilir bir etki bulamadı.

Sadece taşındı

D614G, yüksek frekansta bulunan tek mutasyon değildir. Sars-CoV-2'nin protein kabuğundaki üç mutasyon dizisi de verileri dizileme sırasında giderek daha fazla ortaya çıkıyor ve şimdi virüslerin üçte birinde bulunuyor. Bilinen bir immünojenik bölge olan Orf3a proteininin 57. pozisyonunda tek bir değişiklik, çeyrekte meydana gelir. Başak proteininde başka mutasyonlar bulunurken, sayısız diğerleri kendi bağışıklık tepkimizin aktivitesinden kaynaklanıyor gibi görünüyor . Aynı zamanda, bunların veya diğerlerinin virüs bulaşabilirliğini veya virülansı önemli ölçüde değiştirdiğine dair bir fikir birliği yoktur. Çoğu mutasyon, Sars-CoV-2 başarıyla yayılmaya devam ederken basitçe taşınır.

Ancak değişiklikler, Sars-CoV-2'yi etkileyebilecek tek küçük düzenleme değildir. Sars-CoV-2 yardımcı genleri Orf7b / Orf8'deki delesyonların, Sars-CoV-2'nin virülansını azaltarak hastalarda potansiyel olarak daha hafif enfeksiyonlara yol açtığı gösterilmiştir . Benzer bir silme işlemi , 2002-04'te Sars salgınından sorumlu olan ilgili koronavirüs olan Sars-CoV-1'de de aynı şekilde davranmış olabilir . Daha az öldürücü bir Sars-CoV-2'ye doğru ilerleme memnuniyetle karşılanacaktır, ancak Orf8'deki silinmeler pandeminin ilk günlerinden beri mevcuttu ve sıklıkta artmıyor gibi görünüyor.

Uyarlanabilir değişiklikler henüz gerçekleşebilirken, bu aşamadaki tüm mevcut veriler, pandeminin başlangıcından bu yana aynı virüsle karşı karşıya olduğumuzu gösteriyor. İngiltere'nin baş sağlık görevlisi Chris Whitty, virüsün Birleşik Krallık'ın Mart ayında bir tecrit uygulamasına neden olandan daha hafif bir şeye dönüştüğü fikri üzerine soğuk su dökmekte haklıydı. Yaz boyunca görülen semptom şiddetindeki olası düşüşler, muhtemelen virüsün kendisindeki değişikliklerden ziyade, gençlerin enfekte olmasının, kontrol önlemlerinin (sosyal mesafe alma gibi) ve iyileştirilmiş tedavinin bir sonucudur. Bununla birlikte, Sars-CoV-2 bugüne kadar önemli ölçüde değişmemiş olsa da, gelişimini takip etmek ve izlemek için araçlarımızı genişletmeye ve ayak uydurmaya hazır olmaya devam ediyoruz.

Yorum Gönder (0)
Daha yeni Daha eski